• Создаём репозиторий на Bitbucket

• Переключаемся на перспективу Git
• Клонируем репозиторий на локальную машину
• Появляется строчка с новым локальным репозиторием

• python3 -m venv env
• source env/bin/activate
• pip install –upgrade pip
• pip install django
• в корень добавить .gitignore с содержимым

.gitignore

  *.pyc
  env

• В настройках Eclipse
  • настройка интерпретатора New
  • Путь к интерпретатору env/bin/python3

• Правой кнопкой Import Project
• В диалоге импорта Import using the New Project wizard
• выбираем тип роекта

Eclipse стандартным способом не умеет расшаривать проект в корень репозитория. Только в подпапку.