Копируем эту раскладку в /usr/share/X11/xkb/symbols

~/.vnc/xstartup

#!/bin/sh

unset SESSION_MANAGER
unset DBUS_SESSION_BUS_ADDRESS
setxkbmap vnc_us_ru
exec /etc/X11/xinit/xinitrc

Запускаем

vncserver :3 -geometry 1366x768 -depth 24